แมลงครั่งมีศัตรูที่สำคัญ ๒ พวก คือ
เป็นแมลงตัวเล็ก ๆ เรียกว่าชาลซิด (chalcid) ซึ่งมันชอบวางไข่ไว้ในรังครั่งโดยเข้าไปทางช่องสืบพันธุ์พอฟักตัวอ่อนก็จะอาศัยเกาะกินอาหารในตัวครั่งเลี้ยงชีวิต แมลงพวกนี้ทำความเสียหายให้แก่แมลงครั่งน้อยมากไม่จำเป็นต้องป้องกันและทำลาย
เป็นพวกผีเสื้อกลางคืนมี ๒ ชนิด คือ ยูเบลมา อะมาบิลิส (Eublema amabilis) และฮอลโคเซราพูลเวอเรีย (Holcocera pulverea) จะพากันไปไข่ทิ้งไว้ตามผิวภายนอกของรังครั่งเมื่อฟักเป็นตัวหนอนจะกัดกินทำลายรังครั่งแล้วเจาะไชเข้าไปกินตัวครั่งทำให้เกิดเป็นปล้องโพรงอยู่ภายในรังครั่งเป็นทางยาวไปตามกิ่งไม้ ครั่งได้รับความเสียหายประมาณ ๓๐ เปอร์เซ็นต์ ช่องโพรงที่เกิดจากแมลงพวกนี้ทำลายจะเห็นได้ชัดพวกตัวห้ำที่เป็นตัวแก่แล้วจะเจาะออกมาจากดักแด้มีลักษณะเป็นเส้นใยคล้ายไหมพบกระจัดกระจายอยู่ตามครั่งดิบการป้องกันอย่างง่าย ๆ และไม่สิ้นเปลืองรายจ่าย ได้แก่ การป้องกันโดยวิธีกล (mechanical control) คือ ให้คัดเลือกครั่งที่ปราศจากศัตรูรบกวนทำลายใช้เป็นครั่งพันธุ์และรีบเก็บครั่งพันธุ์ลงจากต้นภายหลังจากปล่อยภายใน ๒ สัปดาห์ เพื่อป้องกันการกระจายของศัตรูครั่งการป้องกันอีกวิธีหนึ่งคือวิธีป้องกันทางชีวภาพโดยใช้แมลงหรือพวกบัคเตรีทำลายแมลงศัตรูด้วยกันซึ่งวิธีนี้ต้องอาศัยความรู้ความชำนาญพอสมควร